Kan şekerinin düzenlenmesi, insulin direnci, karaciğer metabolizması, diyabet, yağ sentezi, obezite, kanser hücresi metabolizması, Warburg etkisi, mitokondri, çekirdek reseptörleri, protein asetilasyonu, kalori kısıtlaması, uzun ömürlülük, hormonlar, doku görevlerinin endokrin düzenlenmesi, kanser kaşeksisi.

Doğuştan ve sonradan kazanılan bağışıklık sistemlerinin moleküler mekanizması ayrıntılı işlenecektir. Dersin konuları; immune cevap, immün supresörler, bağışıklık sistemindeki farklı hücre çeşitlerinin iletişimi ve otoimmün sistemini içermektedir.

Genom verisinin analizi ve yorumlaması için gerekli genombilim ve biyobilişim alanlarının kapsamlı tanıtımı. Sekans verisinin üretilmesi ve ve saklanması. Farklı seviyelerdeki (DNA, mRNA ve protein) genom verisinin karmaşık biyolojik süreçleri araştırmada kullanımı. Yeni nesil dizileme teknolojileri ve bunlara ilişkin veri formatları, ham dizi verisinin derlenmesi ve haritalanması, gen tahminleme ve betimleme, trankriptomiks, fonksiyonel genomiks, genom evrimi, genom çaplı profilleme, filogenomiks ve popülasyon genomiği.

Moleküler biyolojide kullanılan önemli teknikler ve kullanım alanları; klonlama, tek molekül ve tek hücre analizleri, in situ melezleme ile lokasyon belirleme, RNAi taramaları, gen ekspresyon analizleri, model organizma kullanımı ve protein analizi.

Mikrobiyal patogenezin temel prensipleri ve teknikleri prokaryotik ve ökaryotik patojenlerin hücreleri kullanarak nasıl hastalık oluşturdukları, bağışıklık sisteminin enfeksiyonlara karşı geliştirdiği savunma mekanizmaları, enfeksiyonlarda patojen ve konak faktörlerin rolü, patogenez mekanizmalarını ve ilişkili hastalıkları çalışmak için geliştirilen yeni teknikler.

Kan şekerinin düzenlenmesi, insulin direnci, karaciğer metabolizması, diyabet, yağ sentezi, obezite, kanser hücresi metabolizması, Warburg etkisi, mitokondri, çekirdek reseptörleri, protein asetilasyonu, kalori kısıtlaması, uzun ömürlülük, hormonlar, doku görevlerinin endokrin düzenlenmesi, kanser kaşeksisi.

Makine mühendisliğinde sıkça kullanılan temel matematik formülasyonları: tensör cebiri, indis notasyonu, koordinat çevrimleri, indis notasyonunda temel tensör operasyonları. Birimler ve birim sistemleri arası çevrimler. Temel makina mühendislik kavramları ve mekanik tasarımdaki kullanımları. Mekanik tasarımın temelleri: Yapılardaki kuvvetler, malzemeler ve gerilimler, malzeme seçimi. Makine mühendisliğinin ana uzmanlık alanları. Tasarım süreci ve takım projelerinde pratik deneyim kazanımı.

Metaller, seramik ve camlar, polimerler ve kompozit malzemelere giriş. Kristal yapı ve bozuklukları. Malzemelerin elastik ve plastik deformasyonu. Sertlik. Sürünme ve gerilim gevşemesi. Viskoelastik deformasyon. Isıl davranış. Yıkım analizi. Evre çizelgeleri. Isıl işlem.

Makina Mühendisliği Tasarımının Temelleri. Kavramsal ürün tasarımı. Katı model tabanlı bilgisayar destekli tasarım ve uygulamaları.

Birinci ve ikinci kanunlar. Enerji koruma ve entropi. Soğutma devreleri, enerji ve güç sistemleri, iç yakımlı makineler gibi mühendislik sistemlerin analizleri. Durum denklemleri ve gaz karışımları için p-v-T ilişkileri.

Kinematik, Kinetik, Kuvvet-İvme, Is-Enerji, Impuls-Momentum Prensipleri.

Kararlı/kararsız hal ısı transferi. Konveksiyon ısı transferi. İçsel ve dışsal akımlar. Işınım ısı transferi. Isı değiştiricisi tasarımı ve analizi.

Makina sistemlerinin modellemesi ve dinamik analizi. Geribesleme kontrol teknikleri.

Malzeme: metallerin atomik yapısı, mekanik özellikler için testler, fiziksel özellikler, ısıl işlemler, demir ve çelikler, diğer metaller, polimerler ve kompozit malzemeler. Yöntemler: döküm, haddeleme, dövme, ekstrüzyon, sac plastik şekillendirme yöntemleri, toz metalürjisi, polimer ve kompozit üretim yöntemleri, hızlı prototipleme ve talaşlı imalat (torna ve freze işlemleri). Mühendislik ölçümleri ve cihazları. CNC kodlama ve simülasyona giriş.

MATLAB?de programlamaya giriş; hesaplama temelleri; kök bulma; direkt ve yinelemeli lineer cebir çözümü; çok değişkenli nonlineer cebir çözümü; eğri uydurma; sayısal türev ve integral; Euler ve FDM sayısal yöntemleriyle ODE ve PDE türevsel denklemlerinin sayısal çözümlemesi; ilk-zamanlı, sınır-değerli, Laplace ve ısı denklemi mühendislik problemlerinin sayısal çözümlemesi.

İndeks notasyonu, tensöriyel cebir, koordinat çevirimi, lineer elastikiyet, gerilim, gerinim, lineer elastik katılar için temel kurallar, edimsiz deplasmanlar prensibi, düzlemsel gerilim ve düzlemsel gerinim, deformasyon kriterleri (von Mises, Tresca, deformasyon yüzeyleri), sertleşme modelleri (eşyönlü sertleşme, kinematik sertleşme), elastikiyet, plastiklik, tek eksenli deformasyon, çok eksenli deformasyon.

Akışkanlar mekaniğinin temellerinin yüksek seviyede sunumu. Kinetik teorinin sürekli ortamlar mekaniği bağlamında akışkanlar dinamiğine bakan yönleri. Tensör analizi ve Navier-Stokes ve enerji denklemlerinin sıkıştırılabilir akışlar için çıkarılması. Sınır şartları ve ara yüzey fenomeni. Viskoz akışlar, sınır tabaka teorisi, potansiyel akışlar ve çevrim (vortisiti) dinamiği. Türbülans ve türbülanslı akışlara giriş.

Roket tepki sistemlerinin tasarım ve analizi. Roket sistemlerindeki temel fizik ve kimya prensipleri işlenecektir. Dersin konsantrasyonu kimyasal roketler üzerine olacak ve sıvı, katı, hybrid sistemlerin tasarım ve analizini içerecektir. Elekrik ve nükleer roket sistemleri de ders kapsamı dahilindedir. Ayrıca fırlatma sistemlerinin temel tasarım ve optimizasyon ilkeleri ile yörünge hesaplamaları işlenecek konular arasındadır.

Yapay zeka, metalurji, alaşım tasarımı, malzeme performansı, yorulma, malzeme mekaniği, makine öğrenmesi, derin öğrenme, büyük veri, yapay zeka ile implant malzeme tasarımı, yüksek sıcaklık malzeme tasarımı, yüksek entropili alaşımlar, şekil hafıza alaşım tasarımı.

Etkileşimli benzetim için geometrik, fizik tabanlı, ve olasılıksal modelleme ve hesaplamalı teknikler: bilgisayar programlama, sayısal yöntemler, grafiksel modelleme ve programlama,fizik tabanlı ve olasılıksal modelleme teknikleri.

Kompozitlere giriş; kompozit üretim yöntemleri; kompozitlerin taşınımındaki korunum denklemleri; üretim yöntemlerinin matematiksel modellenmesi; sayısal çözümleme yöntemleri ve MATLAB?da programlamanın gözden geçirilmesi; termoplastik ve termoset matriksli elyaf takviyeli ileri kompozit malzemeler; sıvı kompozit malzeme üretim yöntemleri; reçine transfer kalıplama (RTK) ve vaküm infüzyonu (Vİ) yöntemleri ile tasarım, modelleme, simülasyon ve parça üretimi; çevirim içi control, veri toplama ve analizi.

Bilgisayar Destekli Tasarımdan (CAD), Bilgisayar Destekli Üretim ve Ürün Yaratılma Süreçleri. Üretim Otomasyonu. Üretimdeki Modern Sensörler. Bilgisayar Kontrollü Üretim Sistemleri. Bilgisayar destekli Sayısal Kontrol (CNC) ve Takım Tezgahları.Hızlı Prototipleme. Endüstriyel Robotik.

Metal şekillendirme, plastic akış kinetiği, metalik malzemelerde doku ve doku evrimi, hesaplama açısından metal şekillendirme, plastisite ve visko-plastisite, plastic şekillendirmenin modellenmesi, plastic deformasyonun nümerik analizi, klasik plastisite teorileri, mikro yapı modellemesi, kaymanın termodinamiği ve mekaniği, kristal plastisite için pekleşme kanunları, mühendislikte sıkça kullanılan modeler, visko-plastik kendiyle uyumlu modelleme.